液相色譜儀和氣相色譜儀之間的區別是：
1、分析對象之間的區別
GC:適用于氣化程度高，熱穩定性好，沸點低的樣品;但對于沸點高，揮發性差，熱穩定性差，離子和高聚物的樣品，特別是對于大多數生化樣品而言，檢測不到20％的有機物質。HPLC：適用于溶解后可制成溶液的樣品（包括有機介質溶液）,它不受樣品的揮發性和熱穩定性的限制,它是一種分子量大，氣化困難，熱穩定性差的生化樣品，聚合物和離子。類型樣品可用于廣泛的應用，占有機物的80％。
2、流動相位差異的差異
GC：流動相是惰性的，氣體組分與流動相無親和力，僅與固定相相互作用。
HPLC：流動相為液體，流動相和組分具有協同作用力，可提高色譜柱的選擇性，提高分離度，對分離起積極作用。此外，流動相有很多種，房間的選擇范圍很廣。改變流動相的極性和pH也可以調節分離。當選擇具有不同比例的兩種或更多種液體作為流動相時，可以提高分離選擇性。
3.運行條件的差異
GC：變暖操作。
HPLC：室溫，高壓。
液相色譜儀和氣相色譜儀使用上是一致的：
1、打開氮氣，氫氣和空氣發生器的電源開關，調節輸出壓力穩定在0.4Mpa左右（氣體發生器一般在出廠時調整，無需調整）。
2、打開色譜儀氣體凈化器的氣體開關到“開”位置。觀察色譜柱載氣后B的柱前壓力上升并穩定約5分鐘后，打開色譜儀的電源開關。
3、設置每個工作部件的溫度,TVOC分析的條件：
（a）烘箱：初始烘箱溫度50℃，初始時間10分鐘，加熱速率5℃/分鐘，終止溫度250℃，終止時間10分鐘；
（b）噴射器和探測器：均為250°C。用于脂肪酸分析的色譜條件；
（c）進樣器溫度為260°C檢測器溫度為280°C。
4、點火：進行測試溫度升至150°C以上后，打開凈化器上的氫氣和空氣開關閥“ON”,觀察到色譜儀上的氫氣和空氣壓力表分別穩定在0.1Mpa和0.15Mpa左右,按住點火開關進行點火。同時，明亮的金屬片靠近探測器出口，當火開啟時，金屬片上會有明顯的水蒸氣。如果氫氣在6~8秒內未點火，則松開點火開關并重新點火。在點火期間，如果發現水在檢測器出口中的白色聚四氟乙烯蓋中冷凝，則可以擰下檢測器收集器蓋并移除水。確定色譜工作站上是否點燃氫火焰的方法：觀察氫火焰點燃后的基線電壓應高于點火前的基線電壓。
5、打開計算機和工作站，打開方法文件：脂肪酸分析法或碘分析法,顯示屏左下角應該有一個藍色文字，以顯示當前的電壓值和時間。然后，您可以轉動色譜儀放大器面板上點火按鈕上的“粗調”旋鈕，檢查信號是否為路徑,在基線穩定后，輸入樣品并單擊“開始”按鈕或單擊色譜儀旁邊的快捷按鈕以分析色譜數據,在分析結束時，單擊“停止”按鈕，數據將自動保存。
6、關機程序：首先關閉氫氣和空氣源，使氫氣火焰探測器熄滅,在氫氣火焰熄滅后，將烤箱的初始溫度，檢測器溫度和進樣器溫度設置為室溫,溫度降至設定溫度后，關閉色譜儀的電源,后關掉氮氣。
